نیا کورونا وائرس (SARS-Cov-2) نیوکلک ایسڈ ڈیٹیکشن کٹ
New Coronavirus(SARS-Cov-2) Nucleic Acid Detection Kit
(Fluدھاتscent RT-PCR Probe Method) Product Manual
【Product name 】نیا کورونا وائرس (SARS-Cov-2) نیوکلک ایسڈ ڈیٹیکشن کٹ (فلوریسنٹ RT-PCR تحقیقات کا طریقہ)
【Packaging specifications 】25 ٹیسٹ/کِٹ
【Intended usعمر】
یہ کٹ ناسوفرینجیل سویبس، اوروفرینجیل (گلے) کے جھاڑو، پچھلے ناک کے جھاڑو، درمیانی ٹربینیٹ سویبز، ناک سے دھونے اور ناک کے اسپیریٹس میں نئے کورونا وائرس سے نیوکلک ایسڈ کی گتاتمک شناخت کے لیے استعمال کی جاتی ہے جن کو COVID19 کے ذریعے صحت کی دیکھ بھال فراہم کرنے کا شبہ ہے۔ نئے کورونا وائرس کے ORF1ab اور N جینز کا پتہ لگانے کو نئے کورونا وائرس کے انفیکشن کی معاون تشخیص اور وبائی امراض کی نگرانی کے لیے استعمال کیا جا سکتا ہے۔
【Principles of the procedure 】
یہ کٹ مخصوص TaqMan تحقیقات اور ناول کورونا وائرس (SARS-Cov-2) ORF1ab اور N جین کی ترتیب کے لیے بنائے گئے مخصوص پرائمر کے لیے ڈیزائن کی گئی ہے۔ پی سی آر ری ایکشن سلوشن میں مخصوص پرائمر اور فلوروسینٹ پروبس کے 3 سیٹ ہوتے ہیں اہداف کی مخصوص شناخت کے لیے، اور مخصوص پرائمر اور فلوروسینٹ پروبس کا ایک اضافی سیٹ اینڈوجینس ہاؤس کیپنگ جینز کا پتہ لگانے کے لیے کٹ کے اندرونی معیاری کنٹرول کے طور پر استعمال ہوتا ہے۔
ٹیسٹ کا اصول یہ ہے کہ مخصوص فلوروسینٹ پروب کو پی سی آر کے رد عمل میں Taq انزائم کی exonuclease سرگرمی سے ہضم اور انحطاط کیا جاتا ہے، تاکہ رپورٹر فلوروسینٹ گروپ اور بجھے ہوئے فلوروسینٹ گروپ کو الگ کر دیا جائے، تاکہ فلوروسینٹ مانیٹرنگ سسٹم فلوروسینٹ حاصل کر سکے۔ سگنل، اور پھر پی سی آر ایمپلیفیکیشن کے افزودگی اثر کے ذریعے، تحقیقات کا فلوروسینس سگنل ایک سیٹ تھریشولڈ ویلیو-سی ٹی ویلیو (سائیکل تھریشولڈ) تک پہنچ جاتا ہے۔ ٹارگٹ ایمپلیکن نہ ہونے کی صورت میں، پروب کا رپورٹر گروپ بجھانے والے گروپ کے قریب ہوتا ہے۔ اس وقت، فلوروسینس گونج توانائی کی منتقلی ہوتی ہے، اور رپورٹر گروپ کے فلوروسینس کو بجھانے والے گروپ کے ذریعہ بجھایا جاتا ہے، تاکہ فلوروسینٹ پی سی آر آلہ کے ذریعہ فلوروسینٹ سگنل کا پتہ نہ چل سکے۔
ٹیسٹ کے دوران ری ایجنٹس کے استعمال کی نگرانی کرنے کے لیے، کٹ مثبت اور منفی کنٹرولز سے لیس ہے: مثبت کنٹرول میں ٹارگٹ سائٹ ریکومبیننٹ پلاسمڈ ہوتا ہے، اور منفی کنٹرول ڈسٹلڈ واٹر ہوتا ہے، جو ماحولیاتی آلودگی کی نگرانی کے لیے استعمال ہوتا ہے۔ جانچ کے دوران ایک ساتھ مثبت کنٹرول اور منفی کنٹرول سیٹ کرنے کی سفارش کی جاتی ہے۔
【Main comپوننts 】
Cat. No. | BST-SARS-25 | BST-SARS-DR-25 | کمپونents | |
نمe | تفصیلاتification | کوانٹity | کوانٹity | |
مثبت کنٹرول | 180 μL/شیشی | 1 | 1 | مصنوعی طور پر بنائے گئے پلازمیڈ، ڈسٹل واٹر |
منفی کنٹرول | 180 μL/شیشی | 1 | 1 | آست پانی |
SARS-Cov-2 مکس | 358.5 μL/شیشی | 1 | / | مخصوص پرائمر جوڑے، مخصوص پتہ لگانے والے فلوروسینٹ پروبس، dNTPs، MgCl2، KCl، Tris-Hcl، ڈسٹلڈ واٹر، وغیرہ |
انزائم مکس | 16.5 μL/شیشی | 1 | / | Taq انزائمز، ریورس ٹرانسکرپٹیس، UNG انزائمز، وغیرہ۔ |
SARS-Cov-2 مکس (Lyophilised) | 25 ٹیسٹ/شیشی | / | 1 | مخصوص پرائمر جوڑے، مخصوص پتہ لگانے والے فلوروسینٹ پروبس، ڈی این ٹی پیز، ٹاک انزائمز، ریورس ٹرانسکرپٹیس، ڈسٹلڈ واٹر وغیرہ۔ |
2x بفر | 375 μL/شیشی | / | 1 | MgCl2، KCl، Tris-Hcl، آست پانی، وغیرہ۔ |
نوٹ:(1) مختلف بیچ کٹس کے اجزاء کو ملا یا تبدیل نہیں کیا جاسکتا۔
(2) اپنا ریجنٹ خود تیار کریں: نیوکلک ایسڈ نکالنے کی کٹ۔
【Storage condآئی ٹی آئیons اور expiration date 】
For BST-SARS-25:ایک طویل وقت کے لئے -20±5℃ پر ٹرانسپورٹ اور اسٹور کریں۔
For BST-SARS-DR-25:کمرے کے درجہ حرارت پر نقل و حمل۔ -20±5℃ پر طویل عرصے تک اسٹور کریں۔
بار بار منجمد پگھلنے کے چکروں سے بچیں۔ میعاد کی مدت عارضی طور پر 12 ماہ کے لیے مقرر کی گئی ہے۔
تیاری اور استعمال کی تاریخ کے لیے لیبل دیکھیں۔
پہلی بار کھولنے کے بعد، ریجنٹ کو -20±5 ° C پر 1 ماہ سے زیادہ یا ری ایجنٹ کی مدت کے اختتام تک، جو بھی تاریخ پہلے آئے، بار بار منجمد پگھلنے کے چکروں سے بچنے کے لیے، اور ری ایجنٹ کے منجمد کی تعداد کو محفوظ کیا جا سکتا ہے۔ -پگھلنے کے چکر 6 بار سے زیادہ نہیں ہونے چاہئیں۔
【Applicable instrument】ABI 7500, SLAN-96P, Roche-LightCycler-480۔
【Sample requirements 】
1. قابل اطلاق نمونہ کی قسم: نکالا ہوا نیوکلک ایسڈ حل۔
2. نمونہ ذخیرہ اور نقل و حمل: 6 ماہ کے لیے 20±5℃ پر اسٹور کریں۔ نمونے کو 6 بار سے زیادہ نہ منجمد اور پگھلائیں۔
【Tاندازہing method】
1.Nucleic acid extraction
وائرل نیوکلک ایسڈ نکالنے کے لیے ایک مناسب نیوکلک ایسڈ نکالنے والی کٹ کا انتخاب کریں، اور کٹ کے متعلقہ ہدایات پر عمل کریں۔ Yixin Bio-Tech (Guangzhou) Co., Ltd. یا اس کے مساوی نیوکلک ایسڈ پیوریفیکیشن کٹ کے ذریعے تیار کردہ نیوکلک ایسڈ نکالنے اور صاف کرنے والی کٹ استعمال کرنے کی سفارش کی جاتی ہے۔
2. Reaction reagent prepآراtion
2.1 For BST-SARS-25:
(1) SARS-Cov-2 مکس اور انزائم مکس کو ہٹا دیں، کمرے کے درجہ حرارت پر مکمل طور پر مکس کر کے Vortex ڈیوائس کے ذریعے اچھی طرح پگھلیں اور پھر مختصر طور پر سینٹری فیوج کریں۔
(2) 16.5uL انزائم مکس کو 358.5uL SARS-Cov-2 مکس میں شامل کیا گیا اور مخلوط رد عمل کا حل حاصل کرنے کے لیے اچھی طرح ملایا گیا۔
(3) ایک صاف 0.2 ملی لیٹر پی سی آر آکٹل ٹیوب تیار کریں اور اس پر 15 یو ایل اوپر والے مخلوط رد عمل کے حل کے ساتھ نشان لگائیں۔
(4) 15 μL پیوریفائیڈ نیوکلک ایسڈ محلول، مثبت کنٹرول اور منفی کنٹرول شامل کریں اور آکٹل ٹیوب کیپ کو احتیاط سے ڈھانپیں۔
(5) الٹا کرکے اچھی طرح مکس کریں، اور ٹیوب کے نیچے مائع کو مرکوز کرنے کے لیے جلدی سے سینٹرفیوج کریں۔
1
2.2 For BST-SARS-DR-25:
(1) ری ایکشن مکس تیار کرنے کے لیے SARS-Cov-2 مکس((Lyophilised) میں 375ul 2x بفر شامل کریں۔ پائپٹنگ کے ذریعے اچھی طرح مکس کریں اور پھر مختصر طور پر سینٹری فیوج کریں۔ طویل مدتی اسٹوریج۔)
(2) ایک صاف 0.2 ملی لیٹر پی سی آر آکٹل ٹیوب تیار کریں اور اسے 15μL ری ایکشن مکس فی کنواں کے ساتھ نشان زد کریں۔
(3) 15μL پیوریفائیڈ نیوکلک ایسڈ محلول، مثبت کنٹرول اور منفی کنٹرول شامل کریں اور آکٹل ٹیوب کیپ کو احتیاط سے ڈھانپیں۔
(4) الٹا الٹ کر اچھی طرح مکس کریں، اور ٹیوب کے نچلے حصے میں مائع کو مرکوز کرنے کے لیے جلدی سے سینٹری فیوج کریں۔
3. پی سی آر amplification (آپریشن کی ترتیبات کے لیے براہ کرم انسٹرومنٹ مینوئل سے رجوع کریں۔)
3. 1 پی سی آر 8 ٹیوب کو فلوروسینٹ پی سی آر آلے کے نمونے کے چیمبر میں رکھیں، اور نمونے کو جانچنے کے لیے سیٹ کریں، لوڈنگ کے حکم کے مطابق مثبت کنٹرول اور منفی کنٹرول۔
3.2 فلوروسینس کا پتہ لگانے کا چینل:
(1) ORF1ab جین FAM کا پتہ لگانے والے چینل کا انتخاب کرتا ہے (رپورٹر: FAM، Quencher: None)۔
(2) N جین VIC کا پتہ لگانے والے چینل کا انتخاب کرتا ہے (رپورٹر: VIC، Quencher: None)۔
(3) اندرونی معیاری جین CY5 کا پتہ لگانے والے چینل کا انتخاب کرتا ہے (رپورٹر: CY5، Quencher: None)۔
(4) غیر فعال حوالہ ROX پر سیٹ ہے۔
3.3 پی سی آر پروگرام پیرامیٹر کی ترتیب:
قدم | درجہ حرارت (℃) | وقت | سائیکلوں کی تعداد | |
1 | ریورس ٹرانسکرپشن رد عمل | 50 | 15 منٹ | 1 |
2 | Taq انزائم ایکٹیویشن | 95 | 2.5 منٹ | 1 |
3 | Taq انزائم ایکٹیویشن | 93 | 10 سیکنڈ | 43 |
اینیلنگ ایکسٹینشن اور فلوروسینس کا حصول | 55 | 30 سیکنڈ |
سیٹ کرنے کے بعد فائل کو محفوظ کریں اور ری ایکشن پروگرام چلائیں۔
4.Results analysis
پروگرام ختم ہونے کے بعد، نتائج خود بخود محفوظ ہو جاتے ہیں، اور ایمپلیفیکیشن وکر کا تجزیہ کیا جاتا ہے۔ ایمپلیفیکیشن وکر انسٹرومنٹ ڈیفالٹ تھریشولڈ پر سیٹ ہے۔
【Explanation of test results 】
1. تجربے کی درستگی کا تعین کریں: مثبت کنٹرول FAM، VIC چینل میں ایک عام ایمپلیفیکیشن وکر ہونا چاہیے، اور Ct قدر عام طور پر 34 سے کم ہوتی ہے، لیکن مختلف آلات کی مختلف حد کی ترتیبات کی وجہ سے اس میں اتار چڑھاؤ آ سکتا ہے۔ منفی کنٹرول FAM، VIC چینل کو نان ایمپلیفائیڈ Ct ہونا چاہیے۔ اس بات پر اتفاق ہے کہ مذکورہ بالا تقاضوں کو ایک ہی وقت میں پورا کرنا ضروری ہے، ورنہ یہ امتحان باطل ہے۔
2. نتیجہ کا فیصلہ
FAM/VIC چینل | فیصلے کا نتیجہ |
سی ٹی 37 | نمونہ ٹیسٹ مثبت آیا ہے۔ |
37≤Ct~40 | ایمپلیفیکیشن وکر S کی شکل کا ہے، اور مشکوک نمونوں کی دوبارہ جانچ کی ضرورت ہے۔ اگر دوبارہ امتحان کے نتائج مطابقت رکھتے ہیں، تو اسے مثبت سمجھا جاتا ہے، ورنہ یہ منفی ہے۔ |
Ct≥40 یا کوئی پروردن نہیں۔ | نمونہ ٹیسٹ منفی ہے (یا کٹ کا پتہ لگانے کی نچلی حد سے نیچے) |
نوٹ: (1) اگر FAM چینل اور VIC چینل دونوں ایک ہی وقت میں مثبت ہیں، تو SARS-Cov-2 مثبت ہونے کے لیے پرعزم ہے۔
(2) اگر FAM چینل یا VIC چینل مثبت ہے اور دوسرا چینل منفی ہے، تو ٹیسٹ کو دہرایا جانا چاہیے۔ اگر یہ ایک ہی وقت میں مثبت ہے، تو اسے SARS-Cov-2 مثبت سمجھا جائے گا، ورنہ اسے SARS-Cov-2 منفی سمجھا جائے گا۔